課程結構指課程各部分的組織和配合，即課程內容有機聯系在一起的組織方式。課程結構是課程目標轉化為教育成果的紐帶，是課程活動順利開展的依據。課程結構調整就其實質而言，就是重新認識和確立各種課程類型以及具體科目在學校課程體系中的價值、地位、作用和相互關系。課程結構可分為課程的橫向結構和縱向結構。
1.課程的橫向結構
課程的橫向結構討論的是在一定的課程結構內部，各門各類課程所占的比例及其相互關系。目前對課程結構討論最多的是工具類、知識類、技藝類學科的比例關系以及必修課、選修課、活動課與社會實踐活動之間的關系問題。
2.課程的縱向結構
課程的縱向結構主要有兩種形式：直線型課程和螺旋式課程。
直線型課程指的是將課程內容按照由淺人深、由易到難的原則，在邏輯上前后聯系，直線推進，不重復地進行排列。
螺旋式課程就是按照鞏固性原理，在相鄰的學習單元或年級安排大體相同，但在深度和廣度上不同的內容。
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